Bioinformatica applicata alla genomica (2019/2020)

Codice insegnamento
4S004692
Docente
Maria Romanelli
Coordinatore
Maria Romanelli
crediti
2
Settore disciplinare
BIO/13 - BIOLOGIA APPLICATA
Lingua di erogazione
Italiano
Sede
VERONA
Periodo
A.A. 19/20 dottorato dal 1-ott-2019 al 30-set-2020.

Orario lezioni

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Obiettivi formativi

Il corso si propone di introdurre lo studente all'utilizzo delle banche dati di interesse Biomedico accessibili mediante la rete informatica. L'insegnamento è teso a far acquisire allo studente conoscenze sulle informazioni accessibili dalle principali banche di dati biologici e genetici e sviluppare la capacità di utilizzare strumenti di analisi genomica nello studio delle malattie dell'uomo.

Programma

Il corso prevede esercitazioni pratiche durante le quali verranno utilizzati strumenti computazionali per ll'interrogazione delle principali banche di dati biologici e genetici qulai GeneBank, SwissProt, OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man); verranno analizzate le sequenze del genoma umano utilizzando algoritmi di allineamento, quali BLAST (Basic Local ALIGNEMNT Search Tool) e FASTA, ed applicate strategie di ricerca basate sui programmi di allineamento; verranno utilizzati i programmi accessibili al server ExPASy (Expert Protein Analysis System) per l'analisi delle proteine. Durante il corso verrà fornita una introduzione ai sistemi di analisi del proteoma come integrazione dei database genomici e proteomici.

Testi di riferimento
Autore Titolo Casa editrice Anno ISBN Note
Citterich et al. Fondamenti di bioinformatica Zanichelli 2018 978-88-08-62112-2

Modalità d'esame

IDONEITÀ SULLA BASE DELLA FREQUENZA

DATE E ORARIO: 4 -11-18-25 MAGGIO 2020- ORE 14-16

SEDE: Aula di informatica

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