Pubblicazioni

Autori:

Pozzo, Antonio

Titolo:

HIV-1 negative factor binding to human thioesterase 8: insights from computational biology

Anno:

2011

Tipologia prodotto:

Doctoral Thesis

Tipologia ANVUR:

Altro

Lingua:

Inglese

Parole chiave:

HIV; Nef; hTE; enzyme; homology; molecular dynamics

Abstract (italiano):

Il fattore negativo dell'HIV-1 (Nef) e' una proteina essenziale per il metabolismo del virus. Qui si ricercano le interazioni del Nef con uno dei suoi bersagli nella cellula umana infettata, l'enzima umano tioesterase 8(hTE8). La modellazione per omologia, l'aggancio virtuale tra proteine e gli esperimenti di simulazione di dinamica molecolare vengono condotti su modelli strutturali dell'enzima e del complesso, rispettivamente, con lo scopo di caratterizzare la probabile regione di interazione. Una plausibile, ancorche' approssimativa, regione di legame e' stata identificata. Quest'ultima aiuta a interpretare i dati di mutagenesi relativi al sito esistente. I nostri calcoli suggeriscono inoltre che la dinamica del sistema su larga scala cambia dopo che si e' formato il complesso.

Id prodotto:

59940

Handle IRIS:

11562/349445

depositato il:

25 marzo 2011

ultima modifica:

24 novembre 2022

Citazione bibliografica:

Pozzo, Antonio, HIV-1 negative factor binding to human thioesterase 8: insights from computational biology

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